Blux
作为全栈工程师参与神经技术创业团队，开发动物行为分析、数字孪生与实验软件。当前工作包括小鼠视频分割与追踪、关键点处理，以及视觉流程与游戏引擎的衔接。
Animal behavior · Computer vision · Digital twins
Neuroscience × Engineering
时子延 Ziyan Shi
神经科学博士生 · 全栈工程师
在 Blux 从事动物行为分析与数字孪生系统开发，在西湖大学与深圳医学科学院（SMART）联合培养项目攻读博士。当前关注全脑神经动力学、睡眠与意识，以及神经系统的计算建模。
shiziyan@westlake.edu.cnNow / September 2026
当前工作与研究
Blux 创业团队的工程工作，以及西湖大学与 SMART 的博士训练。
SMART & Westlake
在西湖大学与深圳医学科学院联合培养项目中接受全英文课程训练，目前进行博士科研轮转。围绕全脑神经动力学、睡眠与意识展开学习，结合数据分析、计算建模和实验系统训练。
Whole-brain dynamics · Sleep · Consciousness
睡眠—意识状态动态的端到端模型
模型探索探索从神经信号到状态表征与动态转变的端到端建模，关注睡眠、觉醒及意识相关状态如何随时间变化，以及模型在不同记录与个体之间的适用性。
全脑模拟与假设检验
研究构想探索将全脑连接结构与细胞类型、基因表达信息结合，构建用于假设检验的全脑模拟模型；比较不同连接、局部动力学与扰动条件下的网络活动。
神经科学学习与专题综述
学习与写作系统学习神经科学、计算神经科学与实验方法，围绕神经动力学、睡眠、意识、学习记忆和连接组整理文献，结合论文共读、代码复现与专题综述建立知识框架。
耦合振荡子、旋转波与信息表征
轮转探索结合全脑动力学论文和代码，学习耦合振荡子如何表征与传递信息，探索时空活动模式与感觉运动行为之间的联系。
01 / Collaboration
合作方向
面向神经科学实验室、神经技术团队与开源项目的合作。
02 / Engineering
工程实践
计算机视觉、脑机交互与实验软件开发。
持续推进
小鼠视觉感知与行为追踪
已搭建从深度视频采集、首帧目标标注到 SAM2 分割与追踪的工作流，为后续关键点检测提供输入。继续围绕多视角行为测量与数字孪生推进工程工作。
- 视频采集
- 分割追踪
- 关键点输入
Depth video · SAM2 · Keypoints了解 Blux
原型实践
EEG 脑电机械臂控制
组装 OpenBCI 脑电采集平台，基于 BrainFlow 搭建 SSVEP 脑机交互流程，并接入 OpenArm 机械臂控制。贯通从信号采集、解码到设备执行的原型链路。
- 脑电采集
- SSVEP 解码
- 机械臂执行
OpenBCI · BrainFlow · OpenArm交流实现
也长期使用 Python、Linux / NixOS 和 Web 技术构建科研流程与个人工具。查看 GitHub
03 / Publications
已发表论文
- Ziyan Shi, S. Xu, S. Xue, et al. From machine learning to multimodal models: The AI revolution in enzyme engineering. BioDesign Research, 2026, 8(1): 100044.
- S. Yuan, N. Peng, Ziyan Shi, et al. Detection of algal tiny objects based on morphological features. Concurrency and Computation: Practice and Experience, 2024, 36(17): e8128.
- S. Yuan, N. Peng, Ziyan Shi, Y. Gu, B. Sun. MAgic: A Morphable Attention Based Algal Tiny Object Detection Model. 2023 10th International Conference on Behavioural and Social Computing (BESC), 2023: 1–8.
04 / About
关于我
本科就读于南京师范大学人工智能专业，曾参与藻类目标检测、AI 酶工程等交叉研究。现阶段的工作连接神经科学研究、计算建模与科研软件开发。
长期关注学习记忆与主观体验，尤其是经历如何被编码、保留和重新唤起。希望结合神经数据、全脑模型与实验干预研究这些问题。
查看当前简历- 2026 — 至今
- 西湖大学 × 深圳医学科学院联合培养博士生 · 神经科学方向
- 当前
- Blux · 全栈工程师行为分析软件与科研系统
- 2022 — 2026
- 南京师范大学人工智能 · 本科
I’m Ziyan Shi, a full-stack engineer at Blux and a PhD student in the joint program between Westlake University and the Shenzhen Medical Academy of Research and Translation (SMART). I build tools for animal behavior tracking and brain–computer interfaces, with research interests in whole-brain dynamics, sleep, consciousness, and memory. I welcome collaborations in research software, computer vision, and neurotechnology.
Elsewhere
工具、笔记与归档
日常使用的软件，以及一路积累的学习记录。
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